小鼠全血提了 RNA,溶于水之后能在-80 放多久?做建库,rin 值不降低?
Created on: October 30, 2026
Answered using GPT-5.6 Thinking by Chat01
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小鼠全血提了 RNA,溶于水之后能在-80 放多久?做建库,rin 值不降低?
如果是已经纯化好的小鼠全血总 RNA,最后溶在 RNase-free 水里并放 −80°C,一般可以保存较久;真正影响 RIN 的往往不是“放了几个月”,而是RNase 污染、反复冻融、样本本身残留盐/金属离子和保存前已有降解。我查一下几个常用建库/质控厂商的建议,给你一个更实用的时间范围。
可以。已经提纯、溶在 RNase-free water 里的小鼠全血总 RNA,−80°C 保存用于后续建库,保守地按 1 年以内使用是比较稳妥的。 Illumina 对 RNA 建库样品的官方建议就是:RNA 可溶在 RNase-free water 或 TE 中,在约 −80°C(−85~−65°C)保存 最长 1 年,同时避免多次冻融。Thermo Fisher 也给出类似建议,认为 RNA 在 −80°C 一般可稳定保存约 1 年。(support-docs.illumina.com www.thermofisher.com)
但“RIN 完全不降低”没法保证。保存得好的情况下,几周到几个月通常不会因为单纯 −80°C 储存而出现明显 RIN 下降;真正更容易让 RIN 掉的是反复冻融、RNase 污染,以及残留的 Mg²⁺ 等二价离子促进 RNA 水解。QIAGEN 也明确建议纯化 RNA 分装后低温长期保存,减少冻融次数。(www.qiagen.com www.qiagen.com)
如果你的目标是之后做 bulk RNA-seq,我会这样安排:
| 保存情况 | 我的建议 |
|---|---|
| <1个月 | 基本不用担心,−80°C 即可 |
| 1–6个月 | 很稳,正常情况下 RIN 应保持得很好 |
| 6–12个月 | 通常仍然适合建库,但建库前重新测一次 RIN |
| >1年 | 很多样品实际仍然没问题,但不建议直接假定 RIN 没变化,建库前必须 QC |
最重要的是现在就分装。比如一管作为最终建库用,一管专门用来测 Qubit/Nanodrop/RIN。这样以后测 RIN 时不会为了取 1–2 µL 把整管 RNA 反复冻融。Illumina 也明确建议需要重复使用时做 single-use aliquot。(support-docs.illumina.com knowledge.illumina.com)
如果你现在已经溶在普通 nuclease-free water里,没必要为了保存重新换 buffer,直接 −80°C 就可以。若是非常长期保存,Thermo Fisher 提到极低浓度 EDTA(如 0.1 mM)有助于螯合二价离子、减少 RNA 断裂,但如果马上要做建库,我一般不会为了这个再折腾一次 RNA。(www.thermofisher.com)
至于建库需要多少 RIN,要看你的方案。如果是常规 poly(A) mRNA-seq,最好保持 RIN ≥8;Illumina 对经典 mRNA workflow 也推荐至少约 8,因为降解的 RNA 容易出现 3′ bias。(knowledge.illumina.com knowledge.illumina.com) 如果是 total RNA / rRNA depletion,有些方案可以接受明显更低的 RIN,例如 Illumina Stranded Total RNA 对低质量 RNA 有专门的输入范围。(support-docs.illumina.com)
所以,如果你这批小鼠全血 RNA 现在 RIN 比如 8.5–10,分装后直接 −80°C,3–6 个月后再建库,我基本不会担心因为储存本身导致 RIN 明显下降。 1 年以内也属于厂家推荐的保存范围。
如果你告诉我你现在的 RIN、大概浓度(ng/µL)、准备做 polyA 还是 total RNA 建库,以及预计几个月后建库,我可以直接告诉你这批样品怎么分装最合适。