查找目前接受公共数据库研究的期刊

創建於:2025年11月2日

使用 GPT-5 Pro 回答 Chat01

問題

查找目前接受公共数据库研究的期刊

思考

Identifying suitable journals

I’m compiling a list of medical journals accepting studies based on public databases like SEER, NCDB, TCGA, and GEO, ensuring adherence to editorial policies and data requirements.

Evaluating acceptance

I'm gathering info on journals like "BMJ Open" and "PeerJ" that explicitly accept secondary analysis of public datasets, ensuring reliable citations and editorial alignment.

Investigating BMJ Open

I’m reviewing BMJ Open's authors page for terminology like "cohort profile" and "cross-sectional" to understand their stance on secondary analysis/reanalysis.

Navigating the policy
I'm digging into BMJ Open's policy on using secondary data.

Learning about publication

I’m analyzing secondary data analysis in BMJ Open and seeking reanalysis acceptance in PLOS ONE, focusing on replication studies and negative results.

Investigating journals

I'm examining "Scientific Reports" for replication and data reuse. Considering "Journal of Medical Internet Research" for infoveillance and thematic alignment.

Mapping out possibilities

I'm exploring open-access journals like BMJ Open and PLOS ONE, and introspecting on publication strategies.

Mapping the landscape

I’m thinking through the term "replication studies accepted" in the context of "Scientific Reports." This likely involves evaluating if replication efforts are accepted for publication, a crucial aspect of the scientific process.

Laying out the options
I’m identifying journals that accept public database or secondary data studies. This involves generalist open-access journals and sector-specific ones like BMJ Open and the BMC series.

Identifying open journals

I’m gathering a list of journals that accept public database research. Prioritizing those with specific acceptance policies to ensure they align with the query.

Compiling a database

I'm gathering info on secondary data analysis journals and citing them correctly. Considering databases and journals for publication.

Curating journal options

I’m pulling together a list of journals that accept public database research, including generalist OA and domain-specific journals. Notable ones like "Journal of Global Health" and "International Journal of Epidemiology" are highlighted for their openness to secondary data analyses.

Evaluating options

I'm piecing together the effectiveness of "Data Resource Profile" and examining alternatives like "Data in Brief" and "Scientific Data" for dataset descriptors and secondary analysis.

Evaluating journal options

I’m gathering info on journals that accept secondary data and replication studies, like "Nature Scientific Data" and "Royal Society Open Science."

Evaluating journal options

I’m considering secondary data acceptance in medical, public health, and data journals, emphasizing citations for each journal claim.

Mapping journal options

I’m gathering journal sources that accept secondary data, like "PLOS ONE" and "BMJ Open," ensuring citations are valid and specific to each claim.

Clarifying database access

Mapping out distinctions between open public datasets and controlled-access databases like UK Biobank. Noting open access with email requirement for SEER data.

Reasoned for 5m 0s

回答

下面这份清单按学科/常见公共数据库分组,列出截至 2025 年 11 月仍在正常发表基于公开数据库(secondary data / public datasets)研究的主流期刊,并附上近年(多为 2024–2025)已发表的示例或官方页面作佐证,便于你快速筛选与比对。

说明:不同期刊对“公共数据库研究”的要求不尽相同,但大多数并不禁止二次分析,只强调方法学质量、研究价值、伦理与数据可得性声明。下方每条均附近期范文或作者须知链接作为“可接收”的直接证据。


一、综合医学 / 公共卫生(NHANES 等)

  • PLOS ONE(PLOS)
    示例:2025 年 NHANES 二次分析文章;近月多篇基于 MIMIC 的回顾性研究也在该刊发表。(PLOS)

  • BMJ Open(BMJ)
    示例:基于 MIMIC‑IV 与 eICU 的预测模型研究;作者指南长期接受各类原始研究(含二次数据分析),要求给出数据可用性声明。(bmjopen.bmj.com)

  • JAMA Network Open(AMA)
    示例:2024–2025 年多篇 NHANES 二次分析;亦见用 MIMIC‑IV 的方法学/公平性研究,说明对高质量二次分析持开放态度。(JAMA Network)

  • BMC Public Health(Springer Nature | BMC)
    示例:2024–2025 年大量 NHANES 二次分析(伦理段落明确“公开、去标识数据;可豁免 IRB”/提供数据源链接);作者须知要求提供数据可用性声明与公开数据链接。(BioMed Central)

  • Heliyon(Cell Press)
    示例:NHANES 二次分析与多篇 MIMIC‑IV 回顾性队列(重症/肾脏/神经等);亦发表 TCGA/GEO 生信分析。(cell.com)

  • International Journal of Environmental Research and Public Health, IJERPH(MDPI)
    示例:多篇 NHANES 二次分析(营养/体力活动/慢病流行等方向)。(MDPI)


二、临床医学 / 重症、麻醉、心血管(MIMIC / eICU 等)

  • Scientific Reports(Nature Portfolio)
    示例:2024 年发表 MIMIC‑IV 重症回顾性研究(官方 PDF);Nature 体系要求数据可用性声明,但不限制数据来源为“原创采集”。(nature.com)

  • BMC Anesthesiology(BMC)
    示例:基于 MIMIC‑IV 的外科 ICU 电解质/预后研究。(BioMed Central)

  • Frontiers in Neurology / Medicine(Frontiers)
    示例:2024 年 MIMIC‑IV 脑卒中与预后研究;Frontiers 公开 APC 政策并持续发表二次分析结果。(Frontiers)

  • Journal of Thoracic Disease(AME Publishing)
    示例:刊载“基于 MIMIC‑IV 的 COPD 合并急性肾损伤对 30 天死亡影响”的回顾性研究(当期目录可见)。(jtd.amegroups.org)


三、肿瘤与生物信息学(TCGA / GEO / SEER 等)

  • BMC Cancer(BMC)
    示例:2024–2025 年多篇 TCGA/GEO 生信研究与分子亚型分析。(BioMed Central)

  • BMC Bioinformatics / BMC Genomics(BMC)
    示例:发布与 TCGA 二次分析相关的方法/工具论文(如 Web‑TCGA、TCGAplot 等)。(BioMed Central)

  • PeerJ / PeerJ Computer Science(PeerJ)
    示例:NHANES 二次分析、MIMIC 研究,以及综述/工具论文汇总 TCGA 生信应用。(PeerJ)

  • Cancer Medicine(Wiley)
    示例:多篇使用 SEER 的流行病学与机器学习预后研究。(Wiley Online Library)

  • Heliyon(Cell Press)
    示例:TCGA/GEO 生信亚型与预后签名等。(cell.com)


四、(补充)更多接受数据库研究的开放获取期刊(需按方向自选)

  • Journal of Clinical Medicine(MDPI) – 多篇 MIMIC‑IV 临床回顾性研究。(MDPI)
  • PLOS ONE – 同时覆盖 NHANES / MIMIC / 其他公共数据库的二次研究(上文已引)。(PLOS)

投稿前的“合规与质量”快速核对清单

  1. 伦理与合规

    • 公开去标识数据的二次分析常被视为不涉及人类受试者研究或可豁免 IRB,但需按机构/期刊要求在文中明确说明依据(例如美国法规 45 CFR 46.102 的解释)。(ovpr.uconn.edu)
    • 数据库特定要求
      NHANES:公开使用;请在方法与伦理段明确“公开、去标识”及数据获取网址/教程。(CDC)
      MIMIC‑III/IV:需完成人类受试者培训数据使用协议(DUA);文内需写明版本、授权与培训完成信息。(physionet.org)
      SEER:研究数据需签署Research Data Agreement;文内需列明 SEER*Stat 版本与提交批次等。(SEER)
      TCGA/GEO:大部分为可公开访问数据(亦有受控层级);按 GDC/TCGA 指南给出下载路径与数据层级。(Cancer.gov)
  2. 数据可用性与透明度

    • 绝大多数出版社(如 Springer Nature / BMC)要求数据可用性声明,公开数据的文章需在声明里给出超链接准确的版本/批次信息。(springernature.com)
  3. 方法学与期刊适配

    • 期刊越来越重视研究问题的新颖性方法学严谨性。对于“仅做单库、单中心、单时间片、堆砌模型”的文章命中率较低;建议:
      • 尽量多库互证(如 TCGA 发现 + GEO/自有队列验证;MIMIC 发现 + eICU/外部中心验证)。(bmjopen.bmj.com)
      • 明确预注册/分析计划(如观察性研究遵循 STROBE)。
      • 在“局限性”处充分讨论**抽样/混杂/加权(如 NHANES 复杂抽样权重)**等问题(不少 BMC Public Health 文章会在方法中交代权重与加权分析)。(BioMed Central)
  4. 检索验证某刊是否“接收公共数据库研究”

    • 用法一:在该刊官网或近两年的文章里检索关键字:
      site:<期刊域名> NHANES OR MIMIC OR SEER OR TCGA "secondary analysis"
      (例如:在 BMJ OpenPLOS ONEScientific Reports 的近刊中均能检索到对应示例,见上方链接。)(bmjopen.bmj.com)
    • 用法二:查看作者指南是否要求数据可用性声明(通常意味着不排斥二次分析)。(springernature.com)

给你的可操作选刊建议(按常见数据库快速匹配)

  • NHANES(公共卫生/营养/慢病/流行病学):** BMC Public Health**、PLOS ONEJAMA Network OpenIJERPH。(BioMed Central)
  • MIMIC‑IV/III(重症/麻醉/心肺/机器学习):** Scientific Reports**、BMJ OpenFrontiers(Neurology/Medicine)BMC AnesthesiologyHeliyonJournal of Thoracic Disease。(nature.com)
  • TCGA/GEO(肿瘤生信/多组学):** BMC Cancer**、BMC Bioinformatics/GenomicsHeliyonPeerJ。(BioMed Central)
  • SEER(肿瘤流行、预后/竞争风险等):** Cancer Medicine** 等 Wiley 肿瘤系列刊物。(Wiley Online Library)

需要我把范围再缩到最匹配你课题的 5–8 本吗?

把你的学科领域 + 使用的数据集(如 NHANES/MIMIC/TCGA/SEER…)+ 研究主题/设计告诉我,我就按影响范围、命中度(近 2 年同题材收稿情况)、开放获取与 APC 情况,直接给出优先顺序和每本期刊的**“命中要点清单”**(标题/摘要/方法该如何对齐其偏好)。

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