Проанализировав каждый признак, выбрав максимальны...

Создано: 24 августа 2026 г.

Отвечено с использованием GPT-5.6 Thinking от Chat01

Вопрос

QTL DH 30 Морфология 01.03.docx
QTL DH 38 Морфология 06.03.docx

Проанализировав каждый признак, выбрав максимальные пики qtl, если рядом несколько пиков объединить сставить таблицу Номер, группа сцеплени DH30: признак — LOD / % Expl. DH38: признак — LOD / % Expl. Если один локус определяет несколько признаков их объединить

Мысль

Created QTL hotspot clusters and summary spreadsheets across DH lines

Worked for 3m 39s

Ответ

Я проанализировал обе QTL-карты DH30 и DH38 и собрал сводную таблицу. В исходных данных для каждого признака использованы выделенные максимальные пики; повторяющиеся пики одного признака по 12/14/16 часам объединены, а соседние пики я считал одним локусом при расстоянии до 5 cM. Для такого локуса оставлял максимальный LOD, а если в той же области определяются несколько признаков — объединял их в одной записи. Исходные значения, например, для DH30 по началу цветения представлены по группам 02, 07 и 08 (QTL DH 30 Морфология 01.03.docx), а для DH38 — по R02, R04, R06, R07 и R09 (QTL DH 38 Морфология 06.03.docx).

В Excel есть именно запрошенная сводная таблица с колонками «Номер», «Группа сцепления», «DH30: признак — LOD / % Expl.», «DH38: признак — LOD / % Expl.». Дополнительно добавил листы «По локусам», «Исходные пики» и «Методика», чтобы можно было проверить объединение. Например, в DH30 один из выраженных объединённых локусов группы 05 включает массу растения, окраску листовой пластинки, ширину черешка и длину черешка; исходные высокие значения для массы растения в этой области достигают LOD 4,76 и 76,8% объяснённой вариации. (QTL DH 30 Морфология 01.03.docx)

Скачать итоговую таблицу QTL DH30–DH38

Если для понятия «рядом» нужно использовать не 5 cM, а, например, 3 cM или 10 cM, я могу пересобрать таблицу с другим порогом.

Поделиться этим Q&A