Проанализировав каждый признак, выбрав максимальны...
Créé le : 24 août 2026
Répondu en utilisant GPT-5.6 Thinking par Chat01
Créé le : 24 août 2026
Répondu en utilisant GPT-5.6 Thinking par Chat01
Проанализировав каждый признак, выбрав максимальные пики qtl, если рядом несколько пиков объединить сставить таблицу Номер, группа сцеплени DH30: признак — LOD / % Expl. DH38: признак — LOD / % Expl. Если один локус определяет несколько признаков их объединить
Я проанализировал обе QTL-карты DH30 и DH38 и собрал сводную таблицу. В исходных данных для каждого признака использованы выделенные максимальные пики; повторяющиеся пики одного признака по 12/14/16 часам объединены, а соседние пики я считал одним локусом при расстоянии до 5 cM. Для такого локуса оставлял максимальный LOD, а если в той же области определяются несколько признаков — объединял их в одной записи. Исходные значения, например, для DH30 по началу цветения представлены по группам 02, 07 и 08 (QTL DH 30 Морфология 01.03.docx), а для DH38 — по R02, R04, R06, R07 и R09 (QTL DH 38 Морфология 06.03.docx).
В Excel есть именно запрошенная сводная таблица с колонками «Номер», «Группа сцепления», «DH30: признак — LOD / % Expl.», «DH38: признак — LOD / % Expl.». Дополнительно добавил листы «По локусам», «Исходные пики» и «Методика», чтобы можно было проверить объединение. Например, в DH30 один из выраженных объединённых локусов группы 05 включает массу растения, окраску листовой пластинки, ширину черешка и длину черешка; исходные высокие значения для массы растения в этой области достигают LOD 4,76 и 76,8% объяснённой вариации. (QTL DH 30 Морфология 01.03.docx)
Скачать итоговую таблицу QTL DH30–DH38
Если для понятия «рядом» нужно использовать не 5 cM, а, например, 3 cM или 10 cM, я могу пересобрать таблицу с другим порогом.